| داکینگ مولکولی پایگاه داده گیاهان دارویی آفریقایی علیه پروتئین Bcl2 به منظور درمان سرطان |
| کد مقاله : 1011-MPBC2024 |
| نویسندگان |
|
سعید طاهری کوهدل * دانشگاه شهید مدنی آذربایجان |
| چکیده مقاله |
| در یک سلول سالم پروتئین Bcl2 به یکی از شرکای پروتئینی خود یعنی BIM/BAK/BAX متصل است، مگر اینکه یک شرایطی برای شروع آپوپتوز فراهم شود. اختلال در این اتصال منجر به شروع فرایند آپوپتوز و نهایتا درمان سرطان می‌شود. از این رو در این تحقیق با استفاده از تکنیک داکینگ مولکولی، 954 ترکیب گیاه دارویی آفریقایی به همراه مولکول مرجع ونتوکلاکس، به پروتئین Bcl2 داک شد. آماده‌سازی لیگاندها و پروتئین با استفاده از نرم‌افزار دیسکاوری استودیو انجام شد و سپس داکینگ مولکولی در نرم افزار PyRx اجرا شد. نتایج حاصل شامل انرژی اتصال، تصاویر دو بعدی و سه بعدی از برهم‌کنش‌های بین لیگاندها و پروتئین با استفاده از نرم‌افزار PyRx و دیسکاوری استودیو تجزیه و تحلیل شدند. نتایج نشان دادند که بسیاری از ترکیبات گیاهی مورد مطالعه از ترکیب مرجع ونتوکلاکس انرژی اتصال منفی‌تری به پروتئین Bcl2 دارند و همچنین برهم‌کنش‌های بیشتری با آمینواسیدهای آن دارند. در نهایت مشخص شد که از بین 954 ترکیب مورد مطالعه و همچنین ترکیب مرجع ونتوکلاکس ترکیب BMC_00069 با انرژی اتصال 11.7- کیلوکالری بر مول و با ایجاد برهم‌کنش‌های واندروالسی، هیدروژنی، پیوند پای، پی آنیونی و آلکیلی، بهترین کاندید دارویی جهت اتصال به Bcl2 و سپس شروع آپوپتوز و نهایتا درمان سرطان است. |
| کلیدواژه ها |
| سرطان، Bcl2، داکینگ مولکولی، گیاهان دارویی، ونتوکلاکس. |
| وضعیت: پذیرفته شده برای ارسال فایل های ارائه پوستر |