شناسایی سه microRNA حفاظت شده و ژن های هدف آنها در گیاه دارویی Capsella rubella
کد مقاله : 1071-MPBC2024 (R1)
نویسندگان
مهدیس براتی فرد *1، احسان محسنی فرد2
1گروه مهندسی تولید و ژنتیک گیاهی_دانشکده‌ ی کشاورزی_ دانشگاه زنجان
2گروه مهندسی تولید و ژنتیک گیاهی-دانشکده کشاورزی- دانشگاه زنجان
چکیده مقاله
MicroRNAها مولکول‌های RNA غیرکدکننده کوچک هستند که در تنظیم بیان ژن‌ها نقش دارند. microRNAها توسط RNA پلیمراز IIرونویسی می‌شوند و پیش‌سازهایی تولید می‌کنند که تحت یک سری رویدادهای برش قرار می‌گیرند تا microRNA بالغ را تشکیل دهند. این مولکول‌های کوچک نقش مهمی در رشد، نمو و پاسخ به محرک‌های زیستی و غیرزیستی ایفا می‌کنند. این پژوهش با هدف شناسایی microRNAهای حفاظت‌شده و ژن‌های هدف آنها در گیاه Capsella rubella انجام شد. در ابتدا با استفاده از microRNAهای آرابیدوپسیس رونوشت‌های همولوگ آن‌ها در C.rubella شناسایی شد. سپس ساختار ساقه–حلقه تولید کننده microRNAهای بالغ ترسیم شده و در نهایت ژن‌های هدف بالقوه هرکدام از microRNAها مشخص شد. در مجموع سه microRNA حفاظت‌شده در این گیاه با نام‌های Cru-miR156 ، Cru-miR169 و Cru-miR171 شناسایی شد که برای آن‌ها در مجموع 18 ژن هدف بالقوه مشخص گردید. این ژن‌ها عمدتا فاکتورهای رونویسی هستند که در بسیاری از فرایندهای مهم گیاه ایفای نقش می‌کنند. تاکنون هیچ microRNA برای این گیاه در پایگاه‌های اطاعاتی معرفی نشده و این اولین گزارش در زمینه microRNA و ژن‌های بالقوه آن‌ها در گیاه C.rubella می‌باشد. این یافته‌ها می‌توانند درک بهتر فرایندهای تحت کنترل microRNAها از رشد و نمو گرفته تا پاسخ به تنش‌های محیطی را در این گیاه موجب شود.
کلیدواژه ها
بیوانفورماتیک، فاکتور رونویسی، SPL، SCL
وضعیت: پذیرفته شده برای ارسال فایل های ارائه پوستر