| بررسی برهم کنش میان ترکیبات گیاهی مؤثر و پروتئین‌های مهم ساختاری ویروس کووید- 19 بر پایه ی فن داکینگ مولکولی با رویکرد چند هدف گیری |
| کد مقاله : 1100-MPBC2024 |
| نویسندگان |
|
جابر کریمی *1، سوسن رادمان پژوه2، علاء الدین کردنائیج3 1عضو هیات علمی دانشکده کشاورزی دانشگاه شاهد 2دانش آموحته کارشناسی ارشد بیوتکنولوزی کشاورزی، دانشگاه شاهد 3عضو هیات علمی دانشکده کشاورزی دانشگاه شاهد |
| چکیده مقاله |
| ویروس SARS-CoV-2 یک ویروس RNA تک رشته‌ای است که در سالهای اخیر باعث ایجاد پاندمی جهانی کرونا با نام COVID-19 شده و جان ملیونها انسان را گرفته است. هدف این پژوهش بررسی ترکیبات مؤثر گیاهی بر روی پروتئین های مؤثر ویروس COVID-19 با استفاده از تکنیک داکینگ مولکولی است. با توجه به هزینه بالای آزمایشات بالینی و آزمایشگاهی و احتمال بروز خطا در این آزمایشات، امروزه استفاده از روش‌های بیوانفورماتیک در پیش مطالعات و طراحی داروهای جدید مورد توجه پژوهشگران قرار گرفته است. در این روش‌ها، داکینگ مولکولی جایگاه ویژه‌ای دارد و میتوان نحوه ی میان کنش پروتئین‌های گیرنده(Receptor) با ترکیبات زیستی فعال(ligands) را با در نظر گرفتن حالت‌های مختلف مولکول‌های مورد نظر در فضای سه بعدی پیش‌بینی کرده و عوامل مهم در برهم‌کنش پایدارتر دارو را تعیین نمود. روش‌های درمانی مبتنی بر چند هدف گیری نشان دهنده رویکرد مهمی در جهت کشف داروی ضد کووید-19 است. در این پژوهش با رویکرد چند هدف گیری، اثر ترکیبات دارویی گیاهان بر سه پروتئین مهم ویروس کرونا شامل پروتئین پروتئاز اصلی، RDRP و PLP به طور همزمان بررسی گرد ید. نتایج این تحقیق به معرفی چهار ترکیب گیاهی شامل تیافلاوین دی گالات، گالوکاتچین گالات ،هسپریدین و نارینژین به عنوان ترکیبات برتر از لحاظ امتیاز اتصال به هرسه پروتئین ویروس منجرشد. بنابراین به کمک دانش بیوانفرماتیک و استفاده از تکنیک داکینگ مولکولی میتوان ترکیبات موثر بر بیماریهای ویروسی از جمله ویروس عامل بیماری کرونا را بدون صرف وقت و هزینه آزمایشگاهی شناسایی کرد. |
| کلیدواژه ها |
| ویروس کووید-19، بیوانفورماتیک، داکینگ مولکولی، ترکیبات گیاهی، رویکرد چند هدف گیری |
| وضعیت: پذیرفته شده برای ارسال فایل های ارائه پوستر |